Hallo,
ich denke für eure wünsche wird WHMCS wohl oder übel nicht das richtige sein, WHMCS hat seine eigenen Macken, man kann keine workflows aufbauen etc.pp. man kann hier sichlich ein Modul bauen was eure wünsche erfüllt aber da bewegen wir uns dann auch ganz schnell im bereich 500€ + .
WHMCS ist und bleibt eine Webhosting lösung, für das Projektgeschäft ( auch mit Project Addon ) ehr ungeeignet ( schon allein aufgrund der mangelnden Funktionalitäten im Modul )
ubermsith ist extrem teuer , alternativ hostbill wobei ich nicht weiß ob es das kann was ihr braucht.
Ansonsten gibts da noch Blesta etc. pp. die frage ist immer wo solll die Reise hingehen ggf. ist bei euch ein Projektierungstool wesentlich besser angebracht als eine Webhoster lösung.